La filière viti-vinicole s'appuie sur trois structures :
 
• Les coopératives : elles sont au nombre de 5.
Le volume vinifié par les caves coopératives représente 24% de la production.
Au total, elles regroupent 260 sociétaires pour une surface de 400 hectares,
 
• Les producteurs indépendants :
Les exploitations agricoles ayant une activité viticole dans le Jura sont au nombre de 230. Le volume vinifié par ces domaines représente 37% de la production.
A noter qu'il existe environ 250 petites exploitations (<1 ha), qui vendent intégralement leur récolte de raisins ou qui la conservent pour leur consommation personnelle.
 
• Les maisons de négoce :
Elles ont une activité économique significative dans le domaine du négoce du vin dans le Jura.
Le négoce représente 39% du volume de production.
Il faut préciser que presque toutes les maisons ont une activité de négociants-vinificateurs et éleveurs.
 

Organisation du vignoble